Protein–RNA interactions for Protein: Q61550

Rad21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad21Q61550 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad21Q61550 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad21Q61550 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad21Q61550 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad21Q61550 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad21Q61550 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad21Q61550 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad21Q61550 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rad21Q61550 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Rad21Q61550 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad21Q61550 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad21Q61550 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad21Q61550 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad21Q61550 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rad21Q61550 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms