Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Msi1Q61474 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msi1Q61474 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms