Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tfap2bQ61313 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfap2bQ61313 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms