Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usf1Q61069 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Usf1Q61069 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Usf1Q61069 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf1Q61069 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf1Q61069 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf1Q61069 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf1Q61069 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usf1Q61069 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usf1Q61069 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms