Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ift20Q61025 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ift20Q61025 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms