Protein–RNA interactions for Protein: Q60I26

Als2cl, ALS2 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 952 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2clQ60I26 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Als2clQ60I26 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Als2clQ60I26 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Als2clQ60I26 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Als2clQ60I26 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms