Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxg1Q60987 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxg1Q60987 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms