Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klf3Q60980 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klf3Q60980 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms