Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
JrkQ60976 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
JrkQ60976 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrkQ60976 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrkQ60976 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrkQ60976 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
JrkQ60976 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrkQ60976 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrkQ60976 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrkQ60976 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrkQ60976 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrkQ60976 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
JrkQ60976 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms