Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik1Q60934 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik1Q60934 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms