Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DbpQ60925 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DbpQ60925 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DbpQ60925 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DbpQ60925 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DbpQ60925 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DbpQ60925 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DbpQ60925 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms