Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Neurod1Q60867 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Neurod1Q60867 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Neurod1Q60867 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Neurod1Q60867 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Neurod1Q60867 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Neurod1Q60867 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Neurod1Q60867 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Neurod1Q60867 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Neurod1Q60867 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Neurod1Q60867 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Neurod1Q60867 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Neurod1Q60867 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Neurod1Q60867 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Neurod1Q60867 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Neurod1Q60867 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Neurod1Q60867 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Neurod1Q60867 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Neurod1Q60867 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Neurod1Q60867 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Neurod1Q60867 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Neurod1Q60867 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Neurod1Q60867 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Neurod1Q60867 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms