Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot7Q60809 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot7Q60809 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms