Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Traf3Q60803 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Traf3Q60803 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms