Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PmelQ60696 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmelQ60696 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PmelQ60696 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmelQ60696 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmelQ60696 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmelQ60696 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmelQ60696 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmelQ60696 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PmelQ60696 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PmelQ60696 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PmelQ60696 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PmelQ60696 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PmelQ60696 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms