Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sik1Q60670 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sik1Q60670 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sik1Q60670 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms