Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prdm1Q60636 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prdm1Q60636 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms