Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CttnQ60598 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CttnQ60598 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CttnQ60598 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CttnQ60598 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CttnQ60598 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CttnQ60598 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CttnQ60598 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CttnQ60598 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms