Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Scaf1Q5U4C3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scaf1Q5U4C3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms