Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C1

Gprasp1, G-protein coupled receptor-associated sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gprasp1Q5U4C1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gprasp1Q5U4C1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gprasp1Q5U4C1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms