Protein–RNA interactions for Protein: Q5U406

Zfp78, Zinc finger protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp78Q5U406 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp78Q5U406 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp78Q5U406 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms