Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rabl6Q5U3K5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms