Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Trim38Q5SZ99 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Trim38Q5SZ99 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Trim38Q5SZ99 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Trim38Q5SZ99 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Trim38Q5SZ99 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Trim38Q5SZ99 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Trim38Q5SZ99 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim38Q5SZ99 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim38Q5SZ99 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Trim38Q5SZ99 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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