Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myh1Q5SX40 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Myh1Q5SX40 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Myh1Q5SX40 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Myh1Q5SX40 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Myh1Q5SX40 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Myh1Q5SX40 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Myh1Q5SX40 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Myh1Q5SX40 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Myh1Q5SX40 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Myh1Q5SX40 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Myh1Q5SX40 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Myh1Q5SX40 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Myh1Q5SX40 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Myh1Q5SX40 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Myh1Q5SX40 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Myh1Q5SX40 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myh1Q5SX40 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myh1Q5SX40 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Myh1Q5SX40 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms