Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med13Q5SWW4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms