Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r196Q5SVD5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r196Q5SVD5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms