Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ankrd40Q5SUE8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ankrd40Q5SUE8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms