Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AbrQ5SSL4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AbrQ5SSL4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms