Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TefmQ5SSK3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TefmQ5SSK3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms