Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tmprss11eQ5S248 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmprss11eQ5S248 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms