Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH6

Smg7, Protein SMG7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg7Q5RJH6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smg7Q5RJH6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smg7Q5RJH6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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