Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bhlha9Q5RJB0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms