Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc1Q5NCF2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms