Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim58Q5NCC9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim58Q5NCC9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim58Q5NCC9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim58Q5NCC9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim58Q5NCC9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim58Q5NCC9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim58Q5NCC9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim58Q5NCC9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim58Q5NCC9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim58Q5NCC9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim58Q5NCC9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim58Q5NCC9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim58Q5NCC9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim58Q5NCC9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trim58Q5NCC9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim58Q5NCC9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms