Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm12253Q5NC48 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Gm12253Q5NC48 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm12253Q5NC48 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm12253Q5NC48 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm12253Q5NC48 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm12253Q5NC48 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm12253Q5NC48 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm12253Q5NC48 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Gm12253Q5NC48 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm12253Q5NC48 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm12253Q5NC48 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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