Protein–RNA interactions for Protein: Q5M8R5

Gm20852, Predicted gene, 20852, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20852Q5M8R5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20852Q5M8R5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20852Q5M8R5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms