Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vps41Q5KU39 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vps41Q5KU39 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms