Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

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Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp28Q5I043 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp28Q5I043 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp28Q5I043 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp28Q5I043 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Usp28Q5I043 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Usp28Q5I043 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp28Q5I043 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Usp28Q5I043 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Usp28Q5I043 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Usp28Q5I043 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp28Q5I043 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp28Q5I043 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp28Q5I043 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp28Q5I043 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp28Q5I043 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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Usp28Q5I043 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp28Q5I043 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp28Q5I043 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp28Q5I043 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp28Q5I043 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp28Q5I043 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp28Q5I043 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp28Q5I043 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp28Q5I043 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp28Q5I043 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp28Q5I043 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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