Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpm3Q5F4S9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpm3Q5F4S9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpm3Q5F4S9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms