Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkaa1Q5EG47 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms