Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp22Q5DU02 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms