Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrig2Q52KR2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrig2Q52KR2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms