Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Spire1Q52KF3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spire1Q52KF3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms