Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccnl1Q52KE7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccnl1Q52KE7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms