Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rhox3aQ4TU90 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rhox3aQ4TU90 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms