Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa20Q45VN2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms