Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc110Q3V125 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc110Q3V125 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms