Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnah12Q3V0Q1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnah12Q3V0Q1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms