Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrrc43Q3V0L5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc43Q3V0L5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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