Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc9Q3V038 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc9Q3V038 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ttc9Q3V038 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc9Q3V038 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc9Q3V038 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc9Q3V038 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc9Q3V038 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc9Q3V038 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc9Q3V038 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc9Q3V038 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc9Q3V038 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ttc9Q3V038 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ttc9Q3V038 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms